后金统治集团内部的残酷政治斗争，不会因努尔哈赤率领众子侄对神设誓而消失。同样，“怀礼义之心”的诸王贝勒，对于凯觎汗位者，必不能“化导其愚顽”。有汗位，就有激烈的争夺；有争夺，就有酷虐的斗争。这种为争夺皇位而骨肉相残的宫廷斗争史，后来一再重演。
努尔哈赤为加强汗权，同其胞弟舒尔齐发生了权力与财富之争。
早在努尔哈赤起兵之初，舒尔哈齐处于其副手的地位。在明官书中，往往努尔哈赤与舒尔哈齐并称。舒尔哈齐曾以建州卫都督等身份，多次进京“朝贡”，如：
万历二十三年（1595）八月，“建州等卫女直夷人速儿哈赤等赴京朝贡，命如例宴赏”（《明神宗实录》内阁文库本，第23卷）。
万历二十五年（1597）七月，“建州等卫夷人都督都指挥速儿哈赤等一百员名、纳木章等一百员名，俱赴京〔朝〕贡，赐赏如例”（《明神宗实录》第312卷）。
万历三十四年（1606）十二月，“建州卫都督都指挥速儿哈赤等入贡”（谈迁：《国榷》第80卷）。
万历三十六年（1608）十二月，“颁给建州右等卫女直夷人速儿哈赤等一百四十名，贡赏如例”（《明神宗实录》第453卷）。
舒尔哈齐多次进京“朝贡”，这在他兄弟五人中，除其长兄努尔哈赤外是仅见的。
另从朝鲜史籍中，也能反映出舒尔哈齐的显贵地位。如申忠一到费阿拉所绘建州首领住家图录仅二幅，即《木栅内奴酋家图》和《外城内小酋家图》。他所见舒儿哈齐“体胖壮大，面白而方，耳穿银环，服色与其兄一样”（申忠一：《建州纪程图记》图版17）。比申忠一先一月到费阿拉的朝鲜通事河世国，分别受到努尔哈赤和舒尔哈齐的接见与宴赏：
老乙可赤常时所住之家，麾下四千余名，佩剑卫立，而设**椅。唐官家丁先为请入拜辞而罢，然后世国亦为请入，揖礼而出。小乙可赤处一样行礼矣。老乙可赤屠牛设宴，小乙可赤屠猪设宴，各有赏给。（《李朝宣祖实录》第69卷）
朝鲜和明朝的史籍记载，都说明努尔哈赤与舒尔哈齐曾是主副配合、相辅相成的。
但是，努尔哈赤与舒尔哈齐之间的矛盾，在万历二十三年（1595）已见端倪。申忠一见舒尔哈齐家里“凡百器具，不及其兄远矣”；舒尔哈齐也向申忠一力言：“日后你佥使若有送礼，则不可高下于我兄弟。”（申忠一：《建州纪程图记》图版20）这表露出舒尔哈齐对已获权位与财货的不满。尔后，万历二十七年（1599）建州兵征哈达时，努尔哈赤在哈达城下当众怒斥舒尔哈齐，他们之间的裂痕加深。万历三十五年（1607），努尔哈赤以舒尔哈齐在乌碣岩之役作战不力，命将其二将常书、纳奇布论死，后依舒尔哈齐恳请，二将免死，罚常书银百两，夺纳奇布所属牛录。自此，努尔哈赤“不遣舒尔哈齐将兵”（《清史稿·舒尔哈齐传》第215卷），削夺其兵权。万历三十七年（1609）三月，舒尔哈齐被夺去兵权后，郁闷不乐，常出怨言，认为活着还不如死了好，遂移居黑扯木。努尔哈赤命收回其弟舒尔哈齐贝勒的财产阿哈，杀了他的儿子阿布什，又将他的部将武尔坤吊在树上以火烧死。同年，明辽东巡按熊廷弼行“间速酋以断其手足”之策（《熊廷弼书牍》第1卷
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