所垄断。除此之外，从国出口到西方的茶叶，丝绸，陶瓷器等等，也都要通过浩罕汗国。伴随着经济的增长，浩罕汗国也摆脱了处于边境地区荒芜的面貌，加速了社会基本设施的建设，逐渐成为了该地区军事·宗教·商业的心。
‘混’的壮了，自然想把地盘做的大一点，浩罕汗国把目光投向了大清的口袋里的喀什地区。找大哥单练浩罕汗国还没这个勇气，但是玩点损的他们还是敢的，如支持新疆地区的同教兄弟叛‘乱’。浩罕一直支持新疆地区的同教兄弟反抗清廷统治，之前拒绝引渡大和卓之子萨木克，并在英国支持下为萨木克策划复国。萨木克死后，穆罕默德·阿里汗又支持大和卓的孙子张格尔入疆建立赛义德·张格尔苏丹国，并出兵叶尔羌地区。
张格尔之‘乱’引发了几十年未遇的新疆大规模叛‘乱’，起初清朝毅然与浩罕汗国断‘交’，但是这次大叛‘乱’也给清朝在新疆的统治带来了很大打击，使得清政fǔ不得不考虑与浩罕汗国相妥协。道光十年，清朝与浩罕汗国议和，同意了浩罕汗国向新疆六城地区派遣长老，行使领事特权的要求。通过派遣长老，浩罕汗国可以一面保护浩罕商人在新疆的利益，同时直接对浩罕商人征税，从而保证浩罕汗国垄断在六城地区的贸易利益。但是浩罕汗国还是没有放弃其对喀什地区的野心，时常支持和卓族人的复国行动，介入新疆事务。
大清与浩罕汗国在新疆的纷争，很难说的清楚，因为大清认为这是国与国之间的政治问题，浩罕汗国却认为这是他们的宗教事务。也不止是浩罕汗国，几乎整个阿拉伯世界都这么认为，只要是*的事，他们管得着。虽然后来大清也接受了浩罕汗国的想法，但是大清的做法却二到了极点，同意外国人管理本国宗教事务，完全是自己给自己找不自在。这次西北回‘乱’，便成了不自在凸显的契机，大清还只是遇到了*烦，浩罕汗国则把自己给坑死了。
西北一‘乱’，新疆也跟着‘乱’了起来，不过前期一直是各大领主内部掐来掐去，没想到掐架吃亏了的喀什回部首领柯尔克孜伯克司迪尔，派人去浩罕汗国叫帮手了。这帮大哥可没有国界的概念，对于他们来说，大清这边都是可恶的异教徒，葱岭西边那些人才是和他们一个信仰的自己人。所以浩罕汗国的外国人阿古柏，护送着张格尔的儿子布素鲁克，又回到了新疆。回来的第一件事，是把请他们来的司迪尔给赶出了新疆。
本来阿古柏还得几年才能凭借英国人援助的武器，完成对新疆的全面侵略，建立自己的汗国，顺便坑死浩罕汗国，但是果兴阿与俄国的‘激’战改变了他的命运。